Neskatoties uz šīm priekšrocībām, elektroniskajam parakstam, protams, ir arī savas „ēnas puses”. Tā, piemēram, par tā izmantošanu ir jāmaksā. Viena parakstīšanās reize maksā 0,29 Ls, 20 reizes – 2,90 Ls. Ir pieejamas arī atlaides – ja persona vēlas eParakstu lietot veselu gadu neierobežotā daudzumā, ir jāmaksā tikai 6,99 Ls. Tomēr, ja personai ikdienā ir nepieciešams parakstīt neskaitāmus dokumentus vai pārbaudīt citu parakstītus dokumentus, eParaksta lietošanas efektivitāte daudzkārt pārspēj izlietotos naudas līdzekļus. Turklāt, jomās, kur norisinās personu pieprasījumu apstrāde, vai nepieciešams identificēt personas, ir iespējams pat samazināt izmaksas, pārnesot informācijas apmaiņu uz elektronisko vidi. Atšķirībā no personiskas komunikācijas un manuālas personas identitātes pārbaudes, elektroniskā vide piedāvā iespējas veikt šīs darbības automātiski. Jāņem vērā arī fakts, ka elektronisko parakstu nevar izmantot bez interneta, taču mūsdienās bezvadu internets ir pieejams gandrīz visur, tāpēc arī šis trūkums nav ļoti būtisks. Lietojot eParakstu, jāievēro arī dažādi drošības pasākumi, piemēram, jāuzmanās, lai tas netiktu nodots lietošanā trešajām pusēm, lai tas neglabājas kopā ar PIN kodu u.c. Tāpat arī jāpievērš uzmanība tās iekārtas drošībai, no kuras tiek lietots eParaksts (personālā datora drošība, eParaksta neizmantošana uz publiskiem datoriem)[5].…
